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[root@localhost v.north]# cat cloexec1.c

#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <fcntl.h>
#include <stdlib.h>
#include <unistd.h>
#include <ctype.h>

void    exe(int fdindex);
void    main(int argc,char **argv)
{
    int     fd;
    char    cmd[32];

    if (!strcmp(argv[1], "O_CLOEXEC")) {
       fd =open("babakaka.txt", O_RDWR | O_CLOEXEC);
     }
    else {
        fd =open("babakaka.txt", O_RDWR);
     }
    sprintf(cmd, "./cloexec2 system %d", fd);
    system(cmd);
    exe(fd);
}

void	exe(int fdindex)
{
    char    fd[8];

    sprintf(fd, "%d", fdindex);
    execl("./cloexec2", "./cloexec2", "exe", fd,  NULL);
}

[root@localhost v.north]# cat cloexec2.c
#include <stdio.h>
#include <fcntl.h>
#include <string.h>

void    main(int argc,char *argv[])
{
    int    fd = atoi(argv[2]);
    char   buff[32];
    int    cnt;

    printf("%-10s:",  argv[1]);
    memset(buff, 0, 32);
    cnt = read(fd, buff, 8);
    if (cnt >=0 ) {
        printf("child:%s\n",  buff);
     }
    else {
        printf("child:no read\n");
     }
}

[root@localhost v.north]# cat babakaka.txt 
aaaaaaaaaaaaaaaaa

[root@localhost v.north]# ./cloexec1 O-CLOEXEC
system    :child:no read
exe       :child:no read

[root@localhost v.north]# ./cloexec1 O_NOCLOEXEC
system    :child:aaaaaaaa
exe       :child:aaaaaaaa

forkは親プロセスのcurrent->filesを継承します。systemはforkしたプロセスでexeがコールされ、O-CLOEXECはビット単位でのインデックスで、close_on_exec_init[1]による設定で、exeシステムコールで係るインデックスのファイルは継承されません。
current->files->close_on_exec_init[1]
current->files->fd_array[fdindex]

プロセス間でのファイル参照はプロセス間でファイルオープンすればよく、O_NOCLOEXECはpipeの運用上の実装かと。で係る説明はpipeでの説明が多々見受けられますが、実装的にはfileとしての実装で、pipe以外の全ファイルに適用されます。

static inline void __set_close_on_exec(int fd, struct fdtable *fdt)
{
       __set_bit(fd, fdt->close_on_exec);
}

static inline void __clear_close_on_exec(int fd, struct fdtable *fdt)
{
       __clear_bit(fd, fdt->close_on_exec);
}